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化学蛋白质组学技术服务平台能够应用于不同的样品体系中，包括细胞裂解液，活细胞和动物或人体组织，可以解决蛋白质翻译后修饰组学分析，药物靶点鉴定及代谢物结合蛋白分析等重要的生物学问题。
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技术平台一：
基于凝胶的活性蛋白质组学分析（Gel-based
activity-based protein
profiling）示意图。利用特异性的化学探针，可快速分析样品中蛋白质或者酶的活性，也可用于检测化学探针的标记能力及标记靶点。同时其相关联技术（竞争性活性蛋白质组学分析，competitive
activity-based protein profiling）也可用于快速高效发掘小分子抑制剂。（Activity-Based
Protein Profiling: From Enzyme Chemistry to Proteomic Chemistry. Annu.
Rev. Biochem. 2008, 77, 383-414.）
技术平台二：
基于质谱的活性蛋白质组学分析（Liquid
chromatography-mass spectrometry-based platforms for activity-based
protein
profiling）示意图。该技术平台不仅能够鉴定化学探针标记的蛋白质，同时能够精确到标记位点。结合定量蛋白质组技术，例如ReDiMe，SILAC，iTRAQ/TMT，能够同时对化学探针所标记的靶点蛋白质进行蛋白质和位点双重定量分析。（Tandem
orthogonal proteolysis-activity-based protein profiling (TOP-ABPP)--a
general method for mapping sites of probe modification in proteomes. Nat
Protoc. 2007, 2, 1414-25.）
